Intenta lo siguiente:
1. Los temas o plugin de terceros no tienen iconos en la pantalla de inicio. Comprueba si están en los archivos descargados.
2. Reinicia el teléfono para actualizar la pantalla de inicio.
3. Desinstala la aplicación en cuestión y vuelve a instalarla.
4. Desliza hacia arriba en la pantalla de inicio para abrir el cajón de aplicaciones y, a continuación, mantén pulsada la aplicación para arrastrarla a la pantalla de inicio.
5. Para evitar esto en el futuro, pulsa de forma prolongada en la pantalla de inicio, selecciona Ajustes de inicio y activa Congelar diseño de pantalla de inicio para bloquear los iconos de las aplicaciones y los widgets en la pantalla de inicio.